王導的堂兄王敦從荊州順江而下，晉元帝司馬睿憂憤去世，繼位的晉明帝司馬紹苦于手里無兵，只能坐視王敦的專橫跋扈。

王敦在屯駐姑熟期間為了消除北面郗鑒的威脅，逼迫朝廷將郗鑒徹底調離合肥，不料反而讓郗鑒堅定了幫助朝廷平定王敦之亂的決心，郗鑒建議晉明帝正確使用流民軍。

當時流民軍眾多，實力比較可觀的主要有祖約（祖逖之弟）、劉遐和蘇峻等部。然而這些流民帥和朝廷之間互不信任，互相提防，很難合作。郗鑒充當朝廷和流民帥之間溝通的橋梁，讓二者能夠暫時放下芥蒂，聯(lián)手對敵。王敦之亂平定后，郗鑒因功躋身朝廷重臣行列，在晉明帝臨終時被指定為輔政大臣之一。